每一个变形金刚的意识和人格都储存在他脑内的一个部分，将其称为大脑模块。它实为一个极小的微型计算机芯片群，被安置在变形金刚的头部。
通过大脑模块的移植就可以使变形金刚换一个新的身体。（好方便的感觉。。但实际上有很多功能主义者认为这是很下贱的事情，而一些被视为垃圾的变形金刚就试图靠这种方法使自己变得有价值—— IDW时间线）
大脑模块使每个变形金刚散发出一种独特的气味。通过足够灵敏的嗅觉探测器就可以探查到这种气味。
至今为止大脑模块和大脑芯片的关系仍是未解之谜。
